5.2 TP : analyse de données (génomique) (3h)
On se remet doucement en jambes sur Python 3 pour un TP de bio-informatique, mettant essentiellement en jeu la recherche de sous-chaînes et le parcours de structures linéaires.
Documents
- recherche_genome.py
- Une première proposition de correction du TP, où on donne une idée de la progression dans la construction du programme final.
- sequencage.py
- Une proposition de correction plus avancée. Cette version fournit un module python complet et documenté, avec des fonctions auxilliaires non demandées dans le TP mais qui rendent bien plus pratique son utilisation.
Liens utiles
- Sujet du TP 2B0
- Recherche de séquences codantes dans un génome
Séances
- Collège Joseph d’Arbaud, Salon-de-Provence : le vendredi 22 janvier 2016 après-midi (Lionel Vaux)